Die St.-Joseph-Kirche ist Teil des Klosters St. Voršila in der Orlí-Straße. Sie wurde in der Mitte des 17. Jahrhunderts gebaut, obwohl der Stadtrat Vorbehalte gegen diesen Plan hatte, weil es in der Stadt und ihrer Umgebung bereits vierzehn schöne Kirchen gab und wenig Platz für die Häuser der Bürger.
Nach der Enteignung des Klosters im Jahr 1945 wurde es für die Zwecke des Technischen Museums vollständig restauriert, aber nach 1989 wurde das Kloster an den Orden des Heiligen Josef zurückgegeben. Die Krypta der St.-Josephs-Kirche wurde 1994 durch einen zweiten Eingang (der erste Eingang befindet sich unter dem Boden der Kirche) vom Innenhof des Klosters aus zugänglich gemacht. Sie wurde während des Abbaus der Außenausstellung entdeckt, als ein Kran auf den verborgenen Gang fuhr und die Decke einriss.
Nach der Öffnung der Krypta wurde festgestellt, dass die sterblichen Überreste der Nonnen, die entlang der Mauern in 2,5 m tiefen Schächten aufbewahrt wurden, wahrscheinlich während des Raubes durcheinander gebracht worden waren. Dies wurde durch die Entdeckung eines kleinen Zinnsargs mit dem kopflosen Torso einer etwa 120-130 cm großen Frau bewiesen. Es handelte sich um eine Lilie von adliger Geburt, die von ihren Eltern im Kloster untergebracht wurde. Das Skelett trug ein prächtiges rosafarbenes Kleid mit Spitze in einem erstaunlich gut erhaltenen Zustand. Auf dem Deckel des Sarges war ein reich verziertes Wappen gemalt. Nach einer Exhumierung im Jahr 1995 wurden die sterblichen Überreste von insgesamt einhundertsechzig Nonnen auf dem Zentralfriedhof pietätvoll beigesetzt. Die anderen Überreste, die unter dem Ziegelsteinpflaster der Krypta lagen, wurden an Ort und Stelle belassen.
Der quadratische Raum der Krypta, der mit einem stark komprimierten Ziegelgewölbe überwölbt ist, ist sehr gut belüftet und in einem hervorragenden technischen Zustand. Am Kopf der Krypta, zwischen den beiden Eingängen, befindet sich an der Wand eine Steintafel mit dem Text.